Slovníček

Aglutinace - Sérologická reakce aglutinogenu s aglutininem, projevující se agregací aglutinogenu a tvorbou specifických viditelných shluků.

Amplifikace -  Zvýšení počtu kopií molekul RNA nebo DNA. V molekulární diagnostice je amplifikace DNA / RNA nutným předpokladem pro uskutečnění většiny genetických testů.

CCDs - (Cross-reactive carbohydrate determinants) zkříženě reagující uhlovodíkové determinanty jsou uhlovodíkové struktury vázající se na proteiny. Jsou odpovědné za zkříženou reaktivitu sér alergických pacientů vůči širokému spektru alergenů z rostlin a hmyzu.

Exón - exón je oblasť genomu, ktorá sa transkribuje do molekuly mRNA. Niektoré exóny sú kódujúce, t.j. obsahujú informácie pre tvorbu bielkovín, zatiaľ čo iné sú nekódujúce. Gény v genome sa skladajú z exónov a intrónov.

GeneXpert - Systém GeneXpert je uzavřená, samostatná, plně integrovaná a 100% automatizovaná platforma, která umožňuje úplnou automatizaci molekulární analýzy. Je k dispozici v konfiguraci s jedním, dvěma, čtyřmi nebo šestnácti moduly. Všechny používají stejnou patentovanou technologii kazet pro každý test Xpert®.

GIM - German imipenemase (nemecká imipenemáza) bola izolovaná v Nemecku v roku 2002 od piatich pacientov. Táto získaná MBL bola identifikovaná u klonálnych izolátov Pseudomonas aeruginosa na plazmide v rámci integronu triedy 1.

Hemokultivace - mikrobiologické kultivační vyšetření krve na přítomnost bakterií

Chemiluminiscence - Spontánní uvolnění světla, které je výsledkem chemické reakce (může dojít i k omezenému uvolnění tepla).

IMP - Imipenem-hydrolyzujúca β-laktamáza alebo β –laktamáza hydrolyzujúca imipenem patrí do skupiny najviac rozšírených metalo-β-laktamáz.

KPC - karbapenemázy typu KPC (Klebsiella pneumoniae carbapenemase) sa vyskytujú na rozličných prenosných plazmidoch, väčšinou v prítomnosti jednej z izofór transpozónu Tn4401, čo je dôvodom celosvetového rozšírenia tohto génu rezistencie. Gén blaKPC-1 bol poprvé popísaný v roku 2000 v USA u Klebsiella pneumoniae. Poskytoval rezistenciu na imipenem, meropenem, širokospektrálne cefalosporíny aj aztreonam.

MIC - (ang. minimum inhibitory concentration) Minimální inhibiční koncentrace antibiotika je nejnižší koncentrace antimikrobiální chemikálie, která inhibuje viditelný růst mikroorganismu po 24 hodinách inkubace.

NDM - tzv. New Dehli metalo-β-laktamáza bola poprvé popísaná u Klebsiella pneumoniae v Indii, o dva roky neskôr bolo zaznamenané jej rozšírenie po celom svete medzi zástupcami čeľade Enterobacteriaceae. Plazmid, ktorý je zodpovedný za šírenie NDM-1 nesie tiež ďalšie gény rezistencie, a to k makrolidom, aminoglykozídom, sulfamethoxazolu a tiež k aztreonamu.

OXA - Oxacilin hydrolyzujúca β-laktamáza

SPM - Sao Paulo metalo-β-laktamáza alebo Sao Paolo Metalo-β-laktamáza bola prvýkrát izolovaná z Pseudomonas aeruginosa v Brazílii v Sao Paulu, kde spôsobila niekoľko menších epidémií v nemocniciach spojených s vysokou úmrtnosťou. Genetické analýzy okolia génu blaSPM-1 zistili, že nie je súčasťou integronu, ale je asociovaný s bežnými oblasťami obsahujúcimi nový typ transponovateľnej štruktúry.

VIM - Veronská metalo-β-laktamáza kódovaná na integronu

Výtěr z nosohltanu - Způsob odběru klinického testovacího vzorku nosního sekretu ze zadní části nosu a krku. Hltan je část hrdla za ústní a nosní dutinou a nad jícnem a hrtanem – trubice směřující dolů do žaludku a plic. Nosohltan (lat. pars nasalis pharyngis nebo nasopharynx) je horní část hltanu.