16S Microbiom NGS (set A)
Kit pro přípravu knihovny včetně reverzní transkripce, indexů a magnetických kuliček.
GENOVESA je intuitivní a snadno použitelný bioinformatický nástroj pro analýzu NGS dat.
GENOVESA je intuitivní a snadno použitelný bioinformatický nástroj pro analýzu NGS dat. Začátečníkům v analýze NGS umožňuje rychlé a snadné generování relevantních informací o jejich datech NGS, aniž by k tomu potřebovali vlastní specializované bioinformatické odborníky. Na druhou stranu GENOVESA umožňuje zkušeným uživatelům upravovat parametry, používat složitá pravidla filtrování a vizuálně vyhodnocovat varianty na úrovni jednotlivých čtení.
GENOVESA je nezbytnou součástí ViennaLab NGS Assays a kitů fastGEN.
Klíčové vlastnosti:
- Nahrávání souborů fastq prostřednictvím zabezpečeného webového rozhraní.
- Automatizované zpracování a metriky kontroly kvality sekvenačních dat.
- Identifikace a anotace variant z aktuálních relevantních databází a také výběr variant pro generování smysluplného reportu.
- Přednastavené filtry ViennaLab pro zjednodušenou a časově úspornou identifikaci klinicky relevantních variant.
- Sekce vlastního filtru pro přizpůsobení parametrů specifickým potřebám zákazníka (např. Max AF, minimální hloubka čtení, klasifikace patogenity ClinVar).
- Vizuální zobrazení a kontrola SNV a InDels je možná prostřednictvím integrovaného prohlížeče. Analýza a vizualizace CNV a strukturálních variant (SV) jsou k dispozici na vyžádání.